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甲狀腺功能減退癥患者的預(yù)后因其發(fā)病原因不同而有所不同，大部分甲狀腺功能減退癥患者在補(bǔ)充甲狀腺激素后，甲狀腺功能減退癥的癥狀可以消失，機(jī)體代謝逐步恢復(fù)正常，預(yù)后良好。
一過性的甲狀腺功能減退癥患者可以在臨床癥狀逐漸緩解后進(jìn)行藥物減量乃至停藥，停藥后甲狀腺功能減退癥的癥狀和體征也不會(huì)再復(fù)發(fā)，這部分患者的預(yù)后是最好的。
但是大多數(shù)甲狀腺功能減退癥患者需要終身服用甲狀腺激素制劑治療，以保障甲狀腺功能能夠維持在正常水平。一般情況下，只要甲狀腺功能維持在正常范圍內(nèi)，機(jī)體的生理功能不會(huì)受到很大的影響。
長期甚至終身替代治療成為絕大多數(shù)甲狀腺功能減退癥患者的正確選擇。目前對(duì)本病的治療仍然以甲狀腺激素替代治療為主。
未來的研究將會(huì)著眼于原發(fā)性甲狀腺功能減退癥的病因治療，例如采用碘制劑早期預(yù)防和治療克汀病，采用轉(zhuǎn)基因技術(shù)治療橋本氏甲狀腺炎等。