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橋本甲狀腺炎是自身免疫性疾病。目前對(duì)自身免疫的過程、性質(zhì)仍存在爭(zhēng)議，考慮與人類白細(xì)胞抗原有關(guān)，即HLA基因在橋本甲狀腺炎的發(fā)展過程中起了重要作用，但否合并有其它危險(xiǎn)因素暫時(shí)不能明確。同時(shí)吸煙在橋本甲狀腺炎的作用也相當(dāng)明顯，部分病人可能會(huì)因?yàn)槲鼰煻鴮?dǎo)致合并甲減，這是目前橋本甲狀腺炎導(dǎo)致甲減的重要危險(xiǎn)因素。人類的T淋巴細(xì)胞病毒與自身免疫性的相關(guān)性病毒也有報(bào)道，但是目前沒有明確是某一種原因?qū)е聵虮炯谞钕傺椎陌l(fā)生。