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大部分自身免疫性腦炎，如果及時(shí)、適當(dāng)治療可能并不會(huì)對(duì)壽命造成影響。所以要看患者腦炎的類型，是否合并腫瘤，以及是否得到及時(shí)、有效治療，與預(yù)后都有較明確的關(guān)系。

自身免疫性腦炎涵蓋范圍比較廣，疾病預(yù)后與不同類型有較大關(guān)系，特殊抗體相關(guān)的自身免疫性腦炎，比如NMDA腦炎(N-甲基-D-天冬氨酸受體腦炎)，總體預(yù)后較好，80%患者治療之后能夠好轉(zhuǎn)，尤其是早期便開始免疫治療的患者預(yù)后較好。另外抗LGI1抗體腦炎的病死率大約在10%以下，大部分患者不會(huì)影響到壽命。如果是重癥患者可能相對(duì)較重。此外抗GABA受體腦炎且合并腫瘤患者，死亡率大約在10%。