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小腦萎縮可能是遺傳性、變性性疾病導致，也可能是因某些急性病程，如急性小腦炎后期及藥物中毒等引起。在遺傳性疾病中，脊髓小腦變性、Friedreich型共濟失調(diào)、齒狀核紅核蒼白球路易體萎縮癥等可引起小腦萎縮。
在變性性疾病中，多系統(tǒng)萎縮小腦型可引起小腦萎縮。缺血、缺氧性疾病，如急性腦梗死、腦出血、一氧化碳中毒等也可以引起小腦萎縮。
另外，藥物中毒，如苯妥英鈉中毒可引起小腦萎縮。炎癥性疾病，如急性小腦炎后遺癥可導致小腦萎縮。另外，酒精性小腦變性可以導致小腦萎縮，還有神經(jīng)副腫瘤綜合征也可以導致小腦萎縮。
高血壓、高脂血癥、糖尿病、冠心病、酒精等因素可能會誘發(fā)小腦萎縮。