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頭孢克肟和頭孢氨芐都是頭孢菌素類抗菌藥物，兩者都是口服劑型。它們主要的區(qū)別在于頭孢克肟是第三代頭孢菌素，頭孢氨芐是第一代頭孢菌素，兩者抗菌譜的側(cè)重點有所不同。頭孢克肟抗菌譜廣在治療由革蘭氏陰性菌引起的呼吸系統(tǒng)、泌尿系統(tǒng)、膽道系統(tǒng)感染時，頭孢克肟比頭孢氨芐的效果會更好，而對于革蘭氏陽性菌引起的感染，如鏈球菌咽峽炎、皮膚軟組織感染、創(chuàng)傷感染等，則是頭孢氨芐的強項。

頭孢克肟為了更好地對付革蘭氏陰性菌，在化學結(jié)構(gòu)上犧牲了部分對革蘭氏陽性菌的活性，因此頭孢克肟雖然是后面研發(fā)的藥物，但對于革蘭氏陽性菌的殺菌效力卻比不過頭孢氨芐。頭孢克肟的優(yōu)勢在于對革蘭氏陰性菌產(chǎn)生的常見β-內(nèi)酰胺酶較穩(wěn)定，因而對革蘭氏陰性菌有很強的活性，而頭孢氨芐對革蘭氏陽性菌有良好的抗菌活性。